W latach 1896-1897 poprowadzono linię kolejową Olita-Suwałki-Augustów-Grodno stację w Suwałkach ulokowano w północno-wschodniej części miasta. Uroczyste otwarcie linii miało miejsce 13.05.1899 roku. W tym czasie zapewne wybudowano dworzec kolejowy. Zbombardowany we wrześniu 1939 roku. Do lat 90. XX w. ulokowane były w nim: Zakład Przewozów Pasażerskich, Zakład Przewozów Towarowych, Zakład Taboru i Zakład Teleinformatyki Kolejowej.
Projekt zakładał dostosowanie częściowo użytkowanego budynku dworca i przywrócenie mu pełnych możliwości wynikających z jego funkcji. W porozumieniu z Wojewódzkim Konserwatorem Zabytków oraz zgodnie ze współczesnymi wymaganiami, standardami i projektowaniem bez wykluczeń zaprojektowane zostały nowe pomieszczenia Służby Ochrony Kolei, nowe pomieszczenia dla Polskich Kolei Państwowych, zaprojektowano toalety i nadano nowego blasku zaniedbanej poczekalni wraz z innymi pomieszczeniami funkcyjnymi.
Projekt przewiduje również całkowite odświeżenie i naprawy elewacji, wymianę stolarki drzwiowej i okiennej według stanu historycznego i ogólną poprawę warunków termo-izolacyjnych.
Całość zwieńczono nowymi utwardzeniami terenu, układami zieleni oraz oświetleniem komunikacyjnym i akcentującym elewację.
Budynek całkowicie dostosowany do użytkowania przez osoby o szczególnych wymaganiach poprzez poprowadzenie ścieżek fakturowych, System Identyfikacji Audio-wizualnej oraz pochylnię doprowadzoną do głównego wejścia dworca.